（一）办公室
    负责局党委、行政的党务、政务日常工作；负责局党政会议的组织、综合性材料的起草和机关文秘、档案、保密、信息、督查、信访、扶贫工作；负责系统目标考核、机关规章制度的建设工作；负责党风廉政建设、精神文明、宣传及工会、妇联、共青团工作；负责机关事务和机关建设工作；负责上级党委、政府和业务主管部门交办事项的落实及局党委会、局务会研究决定重大事项的落实、督查等工作；负责局机关财务管理工作。
    （二）人事教育科
    负责局机关及直属单位人事、劳动工资、机构编制工作；负责行业劳动仲裁、劳动保护工作；负责拟定并组织实施行业干部职工教育中长期规划和年度计划；负责拟定并组织实施交通行业科技发展规划、交通重大科技项目管理、交通信息化工作；负责交通行业干部管理、人才队伍建设、职业技术教育、执法上岗培训、技术等级考核工作；负责交通系统党员教育、管理、发展工作；负责离退休人员管理工作。
    （三）综合规划科
    负责组织编制全盟公路、水路及行业中长期发展规划；负责各项基础设施项目的前期工作、后期评价、年度计划工作；负责全盟公路养路费、通行费、其他补助费用收支计划的上报、安排、下达及监督检查工作；负责交通基础设施建设投资计划的落实和监督检查工作；负责交通行业统计工作。
    （四）财务审计科
    负责贯彻执行国家及行业的财经方针、政策和法规；负责并指导全盟交通行业财务管理、国有资本金管理工作；负责协调有关财税政策；负责监督检查各项工程建设资金及其他资金的使用情况；负责局机关财务核算、管理工作；负责财务内审工作并协调组织交通专项资金审计、财务收支审计、经济责任审计工作；负责通行费、拖摩畜养路费的管理工作；负责交通征费征稽所（包括经营性公路）的日常检查、考核、经费开支计划管理工作；负责国有资产管理并组织实施有关资产评估、统计分析、资产处置、清产核资等工作。
    （五）交通战备科
    负责全盟交通战备及边防公路建设管理工作；负责全盟道路水路运输发展、建设的监督管理工作；负责协调地方铁路的建设、管理工作；负责交通安全生产管理；负责贯彻交通政策法规、执法监督、行政复议、政务公开、普法依法治理等方面的工作。
    （六）公路科
    负责全盟公路勘测设计管理、招投标管理、工程管理、工程验收、监督检查工作；负责公路设计、概（预）算、施工许可的审批工作；负责公路工程质量监督、工程定额造价管理工作；负责全盟公路普查、养护管理、路政管理工作；负责公路学会日常工作。